Apesar de parecer confusa no inicio, a árvore de diretórios do GNU/Linux é muito bem organizada e é respeitada em praticamente todas as distribuições, podem haver pequenas variações, encontramos os seguintes diretórios:

 

/ (diretório raiz)

Abaixo deste estão:

/bin (diferente do /sbin, este diretório contém vários comandos úteis utilizados tanto para o administrador do sistema quanto para o usuário comum, contem geralmente os shells, e os programas mais comuns);

/boot (diretório onde ficam os arquivo essenciais para o boot do GNU/Linux, fica também os novos kernels recompilados e reinstalados.);

/dev (diretorio onde ficam armazenados arquivos especiais ou arquivos de dispositivos, o GNU/Linux entende todos os dispositivos como arquivos, tanto o seu dispositivo usb quanto sua placa de som estão aqui.);

/etc (diretório com os arquivos de configuração de programas, serviços ou do próprio Linux, é este o diretório em que devem ser procurados os arquivos de configuração);

/home (diretórios local (home) de usuários. Onde ficam os arquivos dos usuários. Pode ser representado por um til (~), são acessíveis por /home/Nomedousuario);

/lib (diretório onde são encontradas as bibliotecas compartilhadas de aplicativos e módulos do kernel);

/lost+found (em sistemas de arquivos com a capacidade de journaling este diretório armazena os dados recuperados pelo fsck);

/mnt (diretório temporário que serve de ponto de montagem para dispositivos de armazenamento, tornando os acessíveis);

/opt (diretório reservado para todos os softwares que não fazem parte da instalação padrão, programas desenvolvidos por terceiros.);

/proc (diretório com sistema de arquivos virtual do kernel que demonstra status de programas ou então informações sobre o hardware, e até mesmo a alteração do status de hardware, não contém arquivos reais)

/root (diretório home do usuário root);

/sbin (diretório com arquivos executáveis de manutenção do sistema e de tarefas administrativas);

/tmp (diretório com arquivos temporários);

/usr (contém uma outra árvore de diretórios compartilhada entre os usuários, bibliotecas, aplicativos, documentação e etc.);

/var (contém dados variáveis como logs de arquivos e spools de impressoras).

Em resumo: